Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA6BQ9H3T3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms