Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms