Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC7Q96NW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC7Q96NW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms