Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00469Q8N7U9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms