Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms