Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L1Q676U5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms