Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms