Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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