Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTF1Q16619 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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