Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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