Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCB1Q12824 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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