Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BDH1Q02338 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms