Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms