Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms