Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PAX9P55771 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAX9P55771 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAX9P55771 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms