Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPGP40121 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPGP40121 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPGP40121 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPGP40121 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPGP40121 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms