Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR1P36897 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms