Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELK1P19419 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELK1P19419 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELK1P19419 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELK1P19419 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELK1P19419 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELK1P19419 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELK1P19419 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms