Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUDT3O95989 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms