Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF40AO75400 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF40AO75400 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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