Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP104O60308 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP104O60308 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP104O60308 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP104O60308 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP104O60308 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP104O60308 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP104O60308 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms