Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms