Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-2B6SEH9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms