Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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