Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MAP1LC3CQ9BXW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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