Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms