Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK3Q9BQ16 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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