Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP9Q99956 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms