Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PRAC1Q96KF2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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