Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms