Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms