Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q6Q795 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q6Q795 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6Q795 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6Q795 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6Q795 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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