Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q1T7F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q1T7F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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