Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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