Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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FXNQ16595 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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FXNQ16595 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FXNQ16595 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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FXNQ16595 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FXNQ16595 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FXNQ16595 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FXNQ16595 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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