Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCINQ13939 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCINQ13939 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCINQ13939 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCINQ13939 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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