Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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