Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF5Q13243 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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