Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GOLGA3Q08378 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GOLGA3Q08378 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GOLGA3Q08378 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms