Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms