Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST1H1AQ02539 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms