Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXK2Q01167 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms