Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms