Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBP60709 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBP60709 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBP60709 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBP60709 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTBP60709 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms