Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP153P49790 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP153P49790 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP153P49790 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP153P49790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP153P49790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms