Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTPAP49638 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTPAP49638 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTPAP49638 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTPAP49638 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms