Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTRNP46939 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTRNP46939 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTRNP46939 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTRNP46939 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UTRNP46939 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UTRNP46939 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTRNP46939 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTRNP46939 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms