Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP8P40818 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP8P40818 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP8P40818 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP8P40818 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP8P40818 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP8P40818 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP8P40818 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms