Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCKARP32238 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCKARP32238 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms