Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC12P31275 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms